Одновременно развивалась научно-практическая деятельность. Был разработан и издан методический сборник «Санитарное просвещение в условиях военного времени», в котором были освещены главные вопросы санитарной агитации и пропаганды в военное время и дан необходимый программный материал. В дальнейшем был разработан и напечатан ряд других методических материалов. Вместе с тем ЦИСП стал разрабатывать и издавать агитационно-массовые и научно-популярные материалы, в первую очередь, на противоэпидемические темы, по санхимзащите.
В массовых журналах и газетах за годы войны ЦИСП напечатаны 65 статей.